Les herbiers sont constitués de phanérogames marines adaptées  à  la  vie  en  immersion,  regroupées en 3 familles principales : les Cymodoceaceae (Cymodocées), les Posidoniaceae (Posidoniacées) et les Zosteraceae (Zosteracées).

Formant des herbiers parfois denses et comparables à des prairies terrestres, cet habitat présente une forte valeur écologique car il constitue un milieu fonctionnel très riche pour diverses espèces végétales et animales (croissance, nourrissage, reproduction...), un réservoir de biodiversité, et qu’il est d’importance pour des espèces d’intérêt halieutique. Les herbiers sont donc protégés et classés comme habitat d’intérêt communautaire majeur au titre de la directive européenne de 1992 « habitat, faune, flore ».

Les principales menaces pesant sur les herbiers sont les activités anthropiques génératrices d’altérations physiques tels que le dragage et chalutage, la pêche à pied ainsi que l’ancrage et le mouillage (par ragage répété  des  chaînes  sur  le  fond).  Les  herbiers  sont  des  milieux sensibles  également  menacés  par  les modifications des caractéristiques sédimentaires et l’altération de la qualité des eaux marines.​